Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrnp27Q8K194 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp27Q8K194 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp27Q8K194 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snrnp27Q8K194 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrnp27Q8K194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp27Q8K194 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms