Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hpf1Q8CFE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpf1Q8CFE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpf1Q8CFE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hpf1Q8CFE2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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