Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms