Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc159Q8C963 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc159Q8C963 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc159Q8C963 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc159Q8C963 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms