Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dclre1bQ8C7W7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1bQ8C7W7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1bQ8C7W7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dclre1bQ8C7W7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1bQ8C7W7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms