Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfrp1Q8C4U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sfrp1Q8C4U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sfrp1Q8C4U3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sfrp1Q8C4U3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms