Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C1R3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C1R3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q8C1R3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C1R3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C1R3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8C1R3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C1R3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8C1R3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C1R3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms