Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd2Q8BY35 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd2Q8BY35 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd2Q8BY35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd2Q8BY35 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd2Q8BY35 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fgd2Q8BY35 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd2Q8BY35 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgd2Q8BY35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd2Q8BY35 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd2Q8BY35 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd2Q8BY35 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms