Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms