Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga3Q8BMI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gga3Q8BMI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gga3Q8BMI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga3Q8BMI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms