Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup93Q8BJ71 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup93Q8BJ71 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup93Q8BJ71 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup93Q8BJ71 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup93Q8BJ71 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup93Q8BJ71 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms