Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy1Q8BIJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy1Q8BIJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms