Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc40Q8BI79 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc40Q8BI79 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc40Q8BI79 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc40Q8BI79 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc40Q8BI79 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms