Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf4Q8BH24 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf4Q8BH24 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm9sf4Q8BH24 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf4Q8BH24 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf4Q8BH24 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms