Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot10Q8BH15 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot10Q8BH15 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnot10Q8BH15 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms