Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8BGC1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8BGC1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8BGC1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8BGC1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8BGC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8BGC1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8BGC1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8BGC1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8BGC1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8BGC1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8BGC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8BGC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8BGC1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8BGC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8BGC1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8BGC1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8BGC1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8BGC1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8BGC1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8BGC1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8BGC1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms