Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms