Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc1Q80VQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc1Q80VQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc1Q80VQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc1Q80VQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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