Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Avl9Q80U56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Avl9Q80U56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Avl9Q80U56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Avl9Q80U56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Avl9Q80U56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms