Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms