Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf8Q80TJ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf8Q80TJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf8Q80TJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phf8Q80TJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf8Q80TJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf8Q80TJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf8Q80TJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms