Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmQ7TSN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmQ7TSN2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmQ7TSN2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClmQ7TSN2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms