Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kcnf1Q7TSH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnf1Q7TSH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnf1Q7TSH7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnf1Q7TSH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnf1Q7TSH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms