Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SyncripQ7TMK9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SyncripQ7TMK9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SyncripQ7TMK9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SyncripQ7TMK9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SyncripQ7TMK9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms