Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg4Q7TMD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg4Q7TMD7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg4Q7TMD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg4Q7TMD7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg4Q7TMD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg4Q7TMD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg4Q7TMD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms