Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efr3bQ6ZQ18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efr3bQ6ZQ18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efr3bQ6ZQ18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efr3bQ6ZQ18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efr3bQ6ZQ18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms