Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Glis3Q6XP49 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Glis3Q6XP49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Glis3Q6XP49 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Glis3Q6XP49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Glis3Q6XP49 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Glis3Q6XP49 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms