Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc154Q6RUT8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc154Q6RUT8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc154Q6RUT8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc154Q6RUT8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc154Q6RUT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc154Q6RUT8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms