Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr12Q6QNU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr12Q6QNU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr12Q6QNU9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr12Q6QNU9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr12Q6QNU9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr12Q6QNU9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms