Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sarm1Q6PDS3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sarm1Q6PDS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sarm1Q6PDS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sarm1Q6PDS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sarm1Q6PDS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms