Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtminQ6P9S1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtminQ6P9S1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AtminQ6P9S1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtminQ6P9S1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtminQ6P9S1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtminQ6P9S1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtminQ6P9S1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtminQ6P9S1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtminQ6P9S1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms