Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgb4Q6P8W9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgb4Q6P8W9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgb4Q6P8W9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgb4Q6P8W9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmgb4Q6P8W9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgb4Q6P8W9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgb4Q6P8W9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.8 ms