Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc148Q6P5U8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc148Q6P5U8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc148Q6P5U8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc148Q6P5U8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms