Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam222bQ6P539 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam222bQ6P539 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam222bQ6P539 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam222bQ6P539 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms