Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg2aQ6P4T0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg2aQ6P4T0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg2aQ6P4T0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg2aQ6P4T0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg2aQ6P4T0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg2aQ6P4T0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg2aQ6P4T0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg2aQ6P4T0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg2aQ6P4T0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg2aQ6P4T0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2aQ6P4T0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms