Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo3Q6P2B1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo3Q6P2B1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo3Q6P2B1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo3Q6P2B1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnpo3Q6P2B1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms