Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rprd2Q6NXI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rprd2Q6NXI6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rprd2Q6NXI6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rprd2Q6NXI6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rprd2Q6NXI6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rprd2Q6NXI6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rprd2Q6NXI6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rprd2Q6NXI6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rprd2Q6NXI6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rprd2Q6NXI6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rprd2Q6NXI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rprd2Q6NXI6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rprd2Q6NXI6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Rprd2Q6NXI6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms