Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE9

Pptc7, Protein phosphatase PTC7 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pptc7Q6NVE9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pptc7Q6NVE9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pptc7Q6NVE9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pptc7Q6NVE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pptc7Q6NVE9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pptc7Q6NVE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pptc7Q6NVE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pptc7Q6NVE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pptc7Q6NVE9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pptc7Q6NVE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pptc7Q6NVE9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pptc7Q6NVE9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms