Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1qtnf6Q6IR41 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1qtnf6Q6IR41 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf6Q6IR41 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf6Q6IR41 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1qtnf6Q6IR41 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1qtnf6Q6IR41 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf6Q6IR41 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf6Q6IR41 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf6Q6IR41 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf6Q6IR41 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf6Q6IR41 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms