Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc5lQ6A068 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdc5lQ6A068 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc5lQ6A068 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc5lQ6A068 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc5lQ6A068 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdc5lQ6A068 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms