Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgefl1Q68EF8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgefl1Q68EF8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgefl1Q68EF8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgefl1Q68EF8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgefl1Q68EF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rapgefl1Q68EF8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms