Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sbno1Q689Z5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sbno1Q689Z5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sbno1Q689Z5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sbno1Q689Z5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sbno1Q689Z5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sbno1Q689Z5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sbno1Q689Z5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Sbno1Q689Z5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sbno1Q689Z5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms