Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpgs2Q66JT5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpgs2Q66JT5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpgs2Q66JT5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpgs2Q66JT5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms