Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdc3Q64519 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc3Q64519 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdc3Q64519 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc3Q64519 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc3Q64519 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc3Q64519 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms