Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp4aQ64436 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp4aQ64436 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp4aQ64436 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp4aQ64436 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms