Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SypQ62277 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SypQ62277 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SypQ62277 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SypQ62277 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SypQ62277 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SypQ62277 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SypQ62277 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SypQ62277 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SypQ62277 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SypQ62277 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SypQ62277 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SypQ62277 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SypQ62277 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SypQ62277 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SypQ62277 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SypQ62277 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SypQ62277 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SypQ62277 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SypQ62277 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SypQ62277 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SypQ62277 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SypQ62277 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SypQ62277 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SypQ62277 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SypQ62277 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SypQ62277 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SypQ62277 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SypQ62277 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SypQ62277 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SypQ62277 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SypQ62277 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SypQ62277 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SypQ62277 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SypQ62277 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SypQ62277 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SypQ62277 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SypQ62277 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SypQ62277 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SypQ62277 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SypQ62277 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SypQ62277 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SypQ62277 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SypQ62277 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SypQ62277 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SypQ62277 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SypQ62277 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SypQ62277 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SypQ62277 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SypQ62277 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SypQ62277 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SypQ62277 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SypQ62277 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SypQ62277 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SypQ62277 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SypQ62277 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SypQ62277 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SypQ62277 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SypQ62277 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SypQ62277 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SypQ62277 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SypQ62277 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SypQ62277 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SypQ62277 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SypQ62277 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SypQ62277 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SypQ62277 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SypQ62277 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SypQ62277 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SypQ62277 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SypQ62277 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SypQ62277 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SypQ62277 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SypQ62277 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SypQ62277 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SypQ62277 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SypQ62277 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SypQ62277 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SypQ62277 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SypQ62277 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SypQ62277 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SypQ62277 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SypQ62277 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SypQ62277 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SypQ62277 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SypQ62277 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SypQ62277 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms