Protein–RNA interactions for Protein: Q62276

Med22, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med22Q62276 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med22Q62276 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med22Q62276 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med22Q62276 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med22Q62276 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med22Q62276 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med22Q62276 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med22Q62276 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med22Q62276 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med22Q62276 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med22Q62276 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med22Q62276 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med22Q62276 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med22Q62276 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med22Q62276 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Med22Q62276 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med22Q62276 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med22Q62276 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med22Q62276 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med22Q62276 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med22Q62276 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med22Q62276 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med22Q62276 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med22Q62276 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med22Q62276 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med22Q62276 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med22Q62276 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med22Q62276 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med22Q62276 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med22Q62276 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med22Q62276 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med22Q62276 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms