Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six1Q62231 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Six1Q62231 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Six1Q62231 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six1Q62231 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Six1Q62231 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Six1Q62231 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Six1Q62231 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Six1Q62231 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Six1Q62231 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six1Q62231 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six1Q62231 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Six1Q62231 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six1Q62231 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six1Q62231 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six1Q62231 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six1Q62231 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six1Q62231 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six1Q62231 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Six1Q62231 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six1Q62231 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1153 ms