Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema4aQ62178 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4aQ62178 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4aQ62178 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4aQ62178 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4aQ62178 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms