Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mre11Q61216 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Mre11Q61216 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mre11Q61216 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mre11Q61216 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms